Η Υπηρεσία Εσωτερικού Ελέγχου εκφράζει τη μεγάλη της έκπληξη και απογοήτευση αναφορικά με τον τρόπο που διεξήγαγε τον έλεγχο επί της Υπηρεσίας Εσωτερικού Ελέγχου η Ελεγκτική Υπηρεσία της Δημοκρατίας, καταλογίζοντας στον Γενικό Ελεγκτή «σοβαρή αμέλεια και ανάρμοστη συμπεριφορά».
Σε ανακοίνωσή της με την οποία απαντά στην σχετική έκθεση της Ελεγκτικής Υπηρεσίας, η Υπηρεσία Εσωτερικού Ελέγχου εκφράζει την άποψη ότι η Ελεγκτική Υπηρεσία παραβίασε θεμελιώδεις αρχές ελέγχου καθώς και τα ίδια τα πρότυπα ελέγχου που οφείλει να ακολουθεί ως Ανώτατο Ελεγκτικό Ίδρυμα του Κράτους.