Η απεικόνιση με οπτική μικροσκοπία είναι απαραίτητη για βιολογικές και βιοϊατρικές μελέτες σε πανεπιστήμια, παθολογικές κλινικές νοσοκομείων, καθώς και στη φαρμακοβιομηχανία. Μπορεί να συνδυαστεί αποτελεσματικά με σύγχρονη βαθιά μάθηση για νευρωνικά δίκτυα, τα οποία διαδραματίζουν κεντρικό ρόλο στην τρέχουσα και ραγδαία ανάπτυξη της τεχνητής νοημοσύνης. Αυτές οι μεθοδολογίες είναι ιδιαίτερα σημαντικές για μελέτες που σχετίζονται με τον προσδιορισμό του φαινοτύπου και την αξιολόγηση θεραπειών για τον καρκίνο.
Η βιοϊατρική μικροσκοπία γίνεται όλο και πιο εκτεταμένη και πολύπλοκη. Οι ληφθείσες εικόνες μπορεί να είναι από μικροσκοπία αντίθεσης φάσης,
